داستان این فیلم درباره‌ی مارتین یک ماهیگیر بدون قایق است ، برادرش استیون به او کمک می‌کند تا زندگی‌اش را بگذراند و او را راهی خانه‌ی دوران کودکی‌اش در بالای بندر می‌کند ، اما…

یک نوجوان ۱۶ ساله به نام ژاکوب پورتمن (ایسا باترفیلد) که یک پناه گاه سری در یک جزیره کشف میکند که در آنجا، کودکان غیرعادی که دارای توانایی های خاصی هستند توسط یک زن (اوا گرین) نگهداری می شوند. ژاکوب قصد دارد با کودکان و افراد ساکن در این جزیره آشنا شود ولی متوجه می شود که اتفاقاتی درحال وقوع است که ممکن است برای آنها خطرناک باشد …